Włókniste proteiny, które zapewniają wytrzymałość na rozciąganie (kolageny, elastyna)
Glikozaminoglikany (GAG)
GAG były pierwotnie znane jako „wypełniacze przestrzeni” w ECM. okazały się być aktywnymi cząsteczkami sygnałowymi, których rola w różnych procesach komórkowych (w tym w produkcji cytokin, rekrutacji leukocytów i odpowiedzi zapalnej) jest ważna dla kontrolowania losu komórki7.
Glikozaminoglikany (GAG) to liniowe polisacharydy złożone dwóch zasadowych sacharydów: aminocukru i kwasu uronowego 2,3. Aminocukrem jest zazwyczaj N-acetylo-D-glukozamina (D-GlcNAc) lub N-acetylo-D-galaktozamina (D-GalNAc). kwasem jest kwas D-glukuronowy (D-GlcA) lub kwas L-iduronowy (L-IdoA) 7. Te podstawowe składniki to dalej zróżnicowane przez epimeryzację, siarczanowanie i deacetylację. Kolejność łańcucha węglowodanowego i inne modyfikacje chemiczne determinują ich specyficzność i funkcjonalność7.
Hialuronian jest najprostszym GAG, ponieważ nie jest siarczanowany, nie ulega epimeryzacji i składa się z niezmodyfikowanych powtórzeń disacharydowych . Nie jest też typowo związany kowalencyjnie z jakimikolwiek białkami. Pozostałe GAG to siarczan chondroityny (CS), siarczan dermatanu (DS), siarczan keratanu (KS) i siarczan heparanu (HS). Te cztery GAG są zazwyczaj kowalencyjnie przyłączone do białek, tworząc proteoglikany. Chondroityna i siarczan heparanu są w znacznym stopniu modyfikowane przez siarczanowanie 1, 2, 3.
Proteoglikany
Proteoglikan składa się z białka rdzeniowego z jednym lub więcej przyłączonymi kowalencyjnie GAG. Są przechowywane w wydzielniczych granulkach, wprowadzane do błony komórkowej lub wydzielane do ECM8. W tabeli 2 wymieniono kilka proteoglikanów wraz z ich masą cząsteczkową, łańcuchami GAG i lokalizacją w tkankach.
Tabela 2. Proteoglikany obecne w ECM8
ProteoGlycans
Core Protein kDA
Liczba łańcuchów
Typ GAG
Tkanka
Małe proteoglikany śródmiąższowe
Decori
36 kDa
1
CS
Wydzielona tkanka łączna
Biglyca
38 kDa
1-2
CS
Wydzielana tkanka łączna
Aggrecan rodzina proteoglikanów macierzy
Aggrecan
208-220 kDa
~ 100
CS, HA, KSII
Wydzielone, chrząstka
Brevican
96 kDa
0-4
CS
Sekretny, mózg
Neurocan
145 kDa
1-2
CS
Sekretny, mózg
Versican
265 kDa
12-15
CS
Wydzielane, fibroblasty
HS proteoglikany
Periecan
400 kDa
1-3
HS
Membrana piwniczna
Agrin
212 kDa
2-3
HS
Membrana piwniczna
Syndecans 1-4
31-45 kDa
1-2 HS; 1-3 CS
HS, CS
Komórki nabłonkowe, fibroblasty
Betaglycan
110 kDa
1 HS, 1 CD
HS
Fibroblasts
Glypicans 1-5
~ 60 kDa
1-3
HS
Komórki nabłonkowe, fibroblasty
Serglicyna
10-19 kDa
10-15 heparyny
CS
Mast Cell
KS proteoglikany
Lumican
37 kDa
nr
KS 1
Szerokie
Keratocan
37 kDa
nr
KS 1
Szerokie
Fibromodulin
59 kDa
nr
KS 1
Szerokie
Mimecan
25 kDa
nr
KS 1
Szeroka
SV2
80 kDa
nr
KS 1
Synaptic vesicles
Claustrin
105 kDa
nr
KS 2
CNS
Glikoproteiny
Laminina
Obecnie istnieje 15 znanych heterotrimerycznych laminin6. Laminina składa się z łańcuchów α, β i γ, z których jest 5 łańcuchów α, 4 β i 6 γ2. Ma konstrukcję krzyżową z 3 krótkimi ramionami i 1 długim ramieniem. Łańcuchy α posiadają dużą domenę kulistą znaną jako domena G na C-końcu. Ta domena składa się z 3 domen LG (LG1-LG3) połączonych regionem linkera z dwoma kolejnymi domenami LG (LG4-LG5).Integriny wiążą się z LG1-3, a dystroglikan z LG4-LG5. Wykazano, że siarczan heparanu wiąże się z LG4 łańcucha α1. Laminina jest składnikiem macierzy piwnicznej; jednakże obecna izoforma lamininy różni się w zależności od tkanki2. Forma lamininy-1 jest najbardziej widoczna we wczesnym rozwoju i składa się z łańcuchów α1, β1 i γ16.
Fibronektyna
Fibronektyna jest dimerem o masie cząsteczkowej ~ 270 kDa. Występuje w postaci rozpuszczalnej we krwi i płynach ustrojowych oraz we włóknach w ECM. Wiąże kolagen, heparynę, inne białka fibronektyny i integryny powierzchniowe komórki. Fibronektyna wiąże integryny poprzez trójpeptydowy motyw argininy, glicyny i kwasu asparaginowego (RGD) 2,3.
Białka włókniste
Kolagen
Kolageny są główny element strukturalny ECM1. Są najbardziej rozpowszechnionym białkiem w skórze i kościach, stanowiąc 25% całkowitej masy białka2. Kolageny stanowią rusztowanie do przyłączania lamininy, proteoglikanów i receptorów na powierzchni komórki1. Jak dotąd zidentyfikowano u kręgowców dwadzieścia osiem typów kolagenów (I – XXVIII )1. Kolageny to potrójne helikalne białka, które powstają z homotrimerów lub heterotrimerów łańcuchów polipeptydowych, określanych jako łańcuchy α. Łańcuchy α mają powtórzenie trzech aminokwasów Gly-XY, gdzie X to zazwyczaj prolina, a Y to 4-hydroksyprolina (prolina zmodyfikowana potranslacyjnie) 1,2.
Opierając się na ich supramolekularnej architekturze, te typy są podzielone na:
fibrylarne (I, II, III, V, XI, XXIV i XXVII) – najpowszechniejszy typ kolagenu, który stanowi 90% kolagenu w organizmie ; jest widoczny w kości, skórze, ścięgnach, więzadłach i chrząstce. Włókna mają średnicę 10-30 nm, a zebrane włókna kolagenowe mogą mieć średnicę 500-3000 nm.
związane z fibrylami (FACIT) (IX, XII, XIV, XVI, XIX, XX , XXI, XXII); te kolageny nie tworzą włókienek; zamiast tego przyczepiają się do kolagenów tworzących włókna; uważa się, że porządkują one włókienka kolagenowe w macierzy
perełki (VI)
tworzące sieci (IV, VIII i X); tworzą one struktury przypominające siatkę, takie jak membrana podstawowa; oddziałują również z kotwiczącymi włóknami (typ VII), które łączą błonę podstawną z kolagenem i lamininą w macierzy zewnątrzkomórkowej. Kolagen IV samoorganizuje się i odgrywa zasadniczą rolę w tworzeniu błony podstawnej.
kolageny przezbłonowe (XIII, XVII, XXIII, XXV) Te suprastruktury pełnią funkcjonalną rolę w adhezji komórek, różnicowaniu, rozwoju tkanki i integralności strukturalnej1.
Elastyna
Elastyna, jak sama nazwa wskazuje, zapewnia elastyczność ECM. Jest produkowany jako tropoelastyna, białko prekursorowe o masie 72 kDa i jest wydzielany z komórki. W przestrzeni zewnątrzkomórkowej sieciuje się z innymi cząsteczkami elastyny, tworząc arkusze i włókna. Elastyna jest głównym białkiem ECM obecnym w tętnicach, gdzie stanowi ~ 50% ich suchej masy2.