C57BL / 6マウスのようなものはありません!

実験に適切なコントロールを使用してデータを正しく解釈するには、使用している特定のC57BL / 6サブストレインを知っておくことが重要です。 C.C.以降リトル（ジャクソン研究所の創設者）は1920年代から1930年代に最初にC57BL近交系を生成し、近交系C57BL / 6は生物医学研究で最も頻繁に使用されるマウス系統になりました。 C57BL / 6近交系マウスの人気により、世界中のさまざまなベンダーや学術機関に多くのコロニーが確立されました。

C57BL / 6亜系統

これを知らないかもしれません：すべて新しいC57BL / 6コロニーが既存のコロニーとは別に20世代以上維持されると、新しいC57BL / 6亜系統になります。世代は累積的であるため、2つの別々のコロニーのそれぞれが10世代（約2〜3年）繁殖する場合、それらは20世代離れており、表現型が異なる可能性のある異なる亜系統です。菌株の命名法の一部として、実験室コードが亜菌株の指定として最後に追加されます。 C57BL / 6Jは親の亜系統です。 「J」はジャクソン研究所の研究所コードです。したがって、「C57BL / 6」マウスのソースはありません。異なるコロニーを維持している研究所または研究所を示す各亜系統には常に長い指定があります。

C57BL / 6亜系統は同じではありません！

新しいC57BL / 6亜系統が一度が確立されると、元のコロニーと新しいコロニーの両方で自然突然変異が発生します。これらの突然変異のサブセットは、遺伝的浮動によってコロニー全体に広がり、固定されます（すべてのマウスでホモ接合）。個々の亜系統が互いに分離されている時間が長いほど、それらの間の遺伝的差異の数は多くなります。これらの遺伝的差異は表現型の差異につながる可能性があります。

C57BL / 6JとC57BL / 6N

1951年、C57BL / 6Jマウスは国立衛生研究所（NIH）に送られました。コロニーが確立され、C57BL / 6Nと呼ばれました。その後、多くの亜系統がC57BL / 6Nコロニーから派生しました。 Crb1rd8として知られる、むらのある網膜変性を引き起こす変異は、すべてのC57BL / 6N関連亜系統でホモ接合性であることが発見されましたが、C57BL / 6J亜系統には存在しません。さらに、国際ノックアウトマウスコンソーシアム（IKMC）表現型センターから収集されたデータにより、C57BL / 6JとC57BL / 6Nの亜系統の間に多数の表現型の違いが見つかりました。

無知の罠に陥る危険性

遺伝的背景（系統および亜系統）または実験用マウスを完全に認識していない場合、深刻な結果が生じる可能性があります。あなたはこの罠に陥った最初の研究者ではありません。間違った対照株を選択すると、データを誤って解釈し、誤った結論に達し、研究プログラムを大幅に遅らせるリスクが高くなります。

私たちのブログ投稿「ハーバード研究所が研究に戻るのに2年かかった理由」は、研究所が免疫不全の表現型をノックアウト対立遺伝子に誤って関連付けた理由を説明しています。特定のC57BL / 6亜系統の変異に対して、ノックアウトが戻し交配されました。ノックアウトモデルが別のベンダーのC57BL / 6亜系統に戻し交配されたときにエラーが発見され、表現型が失われました。ほとんどの場合、労力、また、著者が対象のノックアウトモデルを戻し交配するために使用したものと同じ遺伝的背景を持つ対照マウスを使用した場合、チームが以前の結果を再現できなかった理由を解明するために使用したリソースを節約できたはずです。

この遺伝子は保護的ですか、それとも毒性ですか？

もう1つの注目すべき例は、国立心臓肺血液研究所（NIHの一部）の研究室からのものです。アセトアミノフェンに対するMapk9（Jnk2）ノックアウトの効果をテストした後野生型コントロールとしてC57BL / 6Jを使用した誘発性肝障害、結果は予想に反していました。野生型コントロールとしてC57BL / 6NJ（2005年にNIHからJAXにインポートされたC57BL / 6N）を使用して繰り返すと、Mapk9ノックアウトの表現型はC57BL / 6JとC57BL / 6NJの表現型の中間になりました（図を参照）。

研究者たちは、使用されたコントロールに応じて、2つの相反する方法でデータを解釈できる状況にあることに気づきました。コントロールとしてC57BL / 6Jを使用した場合、データはMAPk9が肝保護的であることを示しました。コントロールとしてC57BL / 6NJを使用した場合、MAPK9は肝毒性があるように見えました。

図1.データの結論対照株の選択により異なります。マウスをアセトアミノフェン（APAP、300mg / kg腹腔内）で治療した。肝障害は、血清アラニンアミノトランスフェラーゼ（ALT）活性の測定により、治療の24時間後に評価されました。

幸い、研究者はMapk9ノックアウトがC57BL / 6Nバックグラウンドにあることを確認でき、遺伝子は肝毒性でした。ただし、このデータがどれほど簡単に誤解され、そのような間違いが完全に見落とされて再現不可能な結果につながる可能性があるかを考えてください！

したがって、注意して、近交系だけでなく、近交系も知っていることを確認してください。 実験に使用しているマウスの近交系。適切なコントロールを選択し、信頼できる意味のあるデータを生成します。 C57BL / 6マウス系統のようなものはなく、常に長い名前が付けられていることを忘れないでください！